柴胡加工隨收獲隨加工，不要堆積時間過長，以防霉爛。把采挖的根用水沖洗干凈進行曬干即可。當曬到7-8成干時，把須根去凈，根條順直，捆成小把再繼續曬干為止，將曬好的柴胡按收購要求裝箱出售。
柴胡炮制工藝：
柴胡：除去雜質和殘莖，洗凈，潤透，切厚片，干燥。
醋柴胡：取柴胡，加醋拌勻，悶透（約4-6小時），置鍋內，用文火炒干，取出，放涼。每100kg柴胡，用醋20kg。
柴胡儲藏養護：
柴胡一般為壓縮打包，每件50公斤。貯存于通風干燥倉庫內，溫度30℃以下，相對濕度65-75%。商品安全水分9-12%。
本品易蟲蛀，受潮生霉，有螨蟲寄居。受潮品軟潤，有的表面現霉斑。為害的倉蟲有鋸谷盜、小蕈甲、黑皮蠹、大竹蠹、煙草甲等，蛀蝕品表面現蛀粉，敲打時有活蟲落下。高溫高濕季節，可見螨蟲活動。
儲藏期間，應保持環境整潔、干燥，并定期消毒。發現吸潮及輕度霉變、蟲蛀，及時晾曬；嚴重時，用磷化鋁或溴甲烷熏殺。有條件的地方可進行密封抽氧充氮養護。
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